全國加油站內部稽核為獨立單位，直接隸屬董事會。稽核主管需列席董事會報告稽核業務，並於必要時向董事長、審計委員會報告。

本公司內部稽核單位現行配置稽核主管及稽核代理人。內部稽核主管之任免，經審計委員會同意，並提董事會決議。內部稽核人員之任免、考評、薪資報酬係由稽核主管簽報董事長核定。

年度稽核作業依據董事會通過之稽核計畫執行，該稽核計畫係依據風險評估結果擬訂，明訂稽核項目、時間、程序及方法等。稽核單位定期或不定期進行例行性及專案稽核，稽核結果檢附工作底稿及相關資料等作成稽核報告呈核，以提供管理階層瞭解內部控制制度之實施情形及潛在可能缺失。